Metafor

Nettoyage blas-lapack

• nettoyage des appels blas/lapack (dont certains étaient toujours via l'interface fortran)
• Creation d'un fichier mtLapack.h gérant l'utilisation d'OpenBlas en remplacement de MKL
• Nettoyage des interfaces fortran/lapack hors de mtBlas.h
• Reprogrammation de matrix::pinv
• Ajout d'une interface python (swig) de l'accès aux composantes (lecture/ecriture) des vecteurs, Matrix/SymMatrix pour générer des tests uniques des fonctions des classes (pas encore commité)
• Ajout d'un fichier de configuration CMake utilisant les OpenBlas (Win64-vs2012-OpenBlas.cmake). Actuellement sans mumps ni mpi (libs pas compilées) ⇒ nouvelle version des libs nécessaire …

• nettoyage/renaming des fonctions de définitions du nombre de threads
  • OpenBlas : pas de distinctions
  • MKL : distingue le nombre de threads des blas (&lapack) / du solver pardiso / des FFT / des VML
• Pour éliminer la confusion, on a désormais les fonctions suivantes :
  • Blas::setBlasNumThreads : défini le nombre de threads des fonctions Blas/Lapack
  • Blas::setPardisoNumThreads : défini le nombre de threads du solveur Pardiso (MKL ONLY)
  • Blas::setFFTNumThreads: défini le nombre de threads des FFT (MKL ONLY)
  • Blas::setVMLNumThreads: défini le nombre de threads des VML (MKL ONLY)
• Vu les limitations de la parallélisation actuelle (interaction threads openMp(blas)/threads tbb)
  • Metafor est initialisé sur 1 thread.
  • l'argument “-k nbthreads” initialise le nombre de threads tbb et le solveur pardiso à “nbthreads”
  • Lorsqu'on aura un autre solveur parallèle, avec une gestion des threads n'interférant pas avec les tbb, je modifiearais le démarrage de Metafor en fonction…

• Nettoyage des includes de frequencyAnalysis
• diminution de la taille des tests répertoire parallèle (de largeTube → tube)
• diminution de la taille de apps/ale/coining3DMUMPS.py (je rappelle que la batterie doit tester la persistance des capacités, pas des niveaux de performances sinon son temps de calcul explose inutilement)
• Suppression du test largeTubeMumpsTbbBlas4 : c'est le “-k” qui est maitre du nombre de threads …
• Ajout d'un test tubeIssTbbBlas
• Correction du ntot de la skyline (qui faisait un overflow par manque d'un cast)
• Correction des workspacesDir de quelques tests de apps.remeshing2 afin qu'ils correspondent aux règles (le nom du workspace doit correspondre au module du test en remplacant les '.' par des '_') et que la suppression des workspaces se fassent correctement …

Added : oo_meta\CMake\win64-vs2012-OpenBlas.cmake
Added : oo_meta\mtMath\mtLapack.h
Renamed : 
Deleted :

Added : 
Renamed : oo_meta\apps\parallel\largeTubeDssTbbBlas.py => tubeDssTbbBlas.py
Renamed : oo_meta\apps\parallel\largeTubeDssTbb1Blas.py => tubeDssTbb1Blas.py
Renamed : oo_meta\apps\parallel\largeTubeDssTbbBlas1.py => tubeDssTbbBlas1.py
Renamed : oo_meta\apps\parallel\largeTubeMumpsTbbBlas.py => tubeMumpsTbbBlas.py
Renamed : oo_meta\apps\parallel\largeTubeMumpsTbb1Blas.py => tubeMumpsTbb1Blas.py
Renamed : oo_meta\apps\parallel\largeTubeMumpsTbbBlas1.py => tubeMumpsTbbBlas1.py
Renamed : oo_meta\apps\parallel\largeTubeSymDssTbbBlas.py => tubeSymDssTbbBlas.py
Renamed : oo_meta\apps\parallel\largeTubeSymMumpsTbbBlas.py => tubeSymMumpsTbbBlas.py
Deleted : oo_meta\apps\parallel\largeTubeMumpsTbbBlas

— Luc Papeleux 2015/08/25