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Mémo NIC4
Nic 4 est le cluster ULG du Ceci.
Il est composé de 168 noeuds : 16 coeurs (2*8) & 64 Gb par noeud.
Plus d'info sur les sites du CECI et du Segi.
La demande de création de compte se fait via ce formulaire.
slurm info
Le gestionnaire de queues sur les clusters du CECI est Slurm. Lisez le Mémo SLURM de Romain avant de commencer …
Configuration du compte pour Metafor
Une fois que vous savez vous connecter sur Nic4 à partir de votre machine qu'elle soit windows ou Linux, il faut configurer votre compte à la compilation/utilisation de Metafor.
Le système de configuration des comptes a été adapté à Nic4.
Si pour des besoins particuliers des modifications de configurations devaient être apportées à la configuration, notez que le serveur d'accès se nomme “master2” (faites vos modifs dans ~/bin/cfg/master2/…
).
Compiler Metafor
Pour compiler Metafor, il faut auparavant recompiler http://www.swig.org/ en version 2.x (la version système est 1.3 et il existe des versions 3.x plus récentes, mais elles sont incompatibles avec la version actuelle de Metafor.
Compilation de Swig
- détarrer les sources (swig-2.0.12.tar.gz)
- configurer : ./configure –without-pcre –prefix=~/local/ (l'installation dans ~/local/ sera automatiquement détectée par le système de configuration de metafor)
- compiler : make
- installer : make install
Compilation de Metafor
La compilation est classique avec CMake. Le fichier oo_meta/CMake/nic4-icc.cmake
défini la configuration actuelle
- avec le compilateur intel
- sans interface graphique (ni vtk, ni Qt)
- sans stp2py
- sans GenIso
- sans Mumps (to do!!!)
Execution de Metafor
ATTENTION : Toute execution sur Nic doit être faite sur le disque /scratch
(tapez cd $SCRATCH
)
le quota sur /home
est fixé à 20Gb…
Launch.py a été adapté à l'utilisation via Slurm. Le système de queue déterminant la priorité des jobs