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--- devel:nic4 [2015/06/23 18:42] – papeleux
+++ devel:nic4 [2015/06/24 10:06] – [Compilation de Swig] ziane
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 ===== Compiler Metafor =====
+==== Compilation de Swig ====
 Pour compiler Metafor, il faut auparavant recompiler [[http://www.swig.org/|]] en version 2.x (la version système est 1.3 et il existe des versions 3.x plus récentes, mais elles sont incompatibles avec la version actuelle de Metafor.
-==== Compilation de Swig ====
   * détarrer les sources (swig-2.0.12.tar.gz)
-  * configurer : ./configure --without-pcre --prefix=~/local/  (l'installation dans ~/local/ sera automatiquement détectée par le système de configuration de metafor)
+  * configurer : ./configure --without-pcre --prefix=$HOME/local/  (l'installation dans ~/local/ sera automatiquement détectée par le système de configuration de metafor)
   * compiler : make
   * installer : make install
-==== Compilation de Metafor ====
+===== Compilation de Metafor =====
 La compilation est classique avec CMake. Le fichier ''oo_meta/CMake/nic4-icc.cmake'' défini la configuration actuelle
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-{{ :devel:launchonnic4.jpg?200 |}}
+{{ :devel:launchonnic4.jpg? |}}
+  * ATTENTION : Le temps de calcul DOIT être écrit au format J-HH:MM:SS (il n'y a pas de validation du format !!!).
+  * ATTENTION : Le temps de calcul max accepté sur nic4 est de 2 jours.
+  * ATTENTION : La memoire est la mémoire TOTALE nécessaire au calcul en Mb.
-ATTENTION : Le temps de calcul DOIT être écrit au format J-HH:MM:SS (il n'y a pas de validation du format !!!).
+launch écrit et soumet à la queue le script ''runSlurm.sh''automatiquement  généré
-ATTENTION : Le temps de calcul max accepté sur nic4 est de 2 jours.
+<code>
-ATTENTION : La memoire est la mémoire TOTALE nécessaire au calcul en Mb.
+#!/bin/bash
+# Metafor launch.py slurm script...
+#SBATCH --job-name=metafor
+#SBATCH --mail-user=lpapeleu
+#SBATCH --mail-type=ALL
+# Ressources needed...
+#SBATCH --partition=defq
+#SBATCH --ntasks=1
+#SBATCH --cpus-per-task=16
+#SBATCH --time=0-0:05:00
+#SBATCH --mem=500
+. /home/ulg/aea/lpapeleu/.bash_profile master2
+srun /home/ulg/aea/lpapeleu/bin/launch.py -x -i $SLURM_JOB_ID -m master2
+</code>
+La configuration d'execution est copiée dans le fichier ''launch$SLURM_JOB_ID.cfg''
+et relu pour lancer l'execution. Un script d'arret/suppression du calcul est aussi généré ''sCancel$SLURM_JOB_ID.py'' alors que la sortie standard est redirigée vers ''slurm-$SLURM_JOB_ID.out'' (en plus des mails d'info).